《轮回的拉格朗日第一季》讲述了在1853年的虚构世界，人类为了与来自月球的外星种族“咸鱼”展开激烈战∵∵。少女阿藤野美夜被卷入战争中，并与身份复杂的机械人YAMATO结缘，在混乱中探寻真相。两位主角通过坚定信念和团队合作，逐渐了解到月球上存在神秘力量，并决意寻找共同抵抗敌人的方法。而随着剧情发展，他们还揭示出隐藏在背后更加残酷的阴谋和真相。