第三季开始，小明和小花加入了飞出未来工作室成为正式成∴∴∴。他们一起设计并制造了一台时间机器，希望可以改变过去的错误和预知未来的危险。然而，当他们试图穿越时空进行探索时，意外引发了一个时间裂缝，将他们困在一个架空且危险的未来世界中。在这个被科技统治、人类沦为奴隶的社会里，他们必须联合其他反抗者与恶势力展开斗争，并寻找修复时间裂缝的方法。同时，小明和小花也逐渐发现自己对彼此产生了更深刻的感情，在挑战中保护彼此，并决心为整个人类创造一个真正美好的未来。