在第二季中，主人公十玖与橘奈緒维持着秘密的关□。他们发现城市正受到名为“废棄检阅者”的组织所威胁，该组织试图摧毁它们创造的新世界。为了保护自己与他人的未来，十玖加入了一个秘密团队，并与他们一起对抗废棄检阅者。然而，在斗争中暴露出来的真相让十玖陷入了迷茫和挣扎之中。他必须决定是否要放弃已经建立的新生活和橘奈緒以及揭示隐藏在幕后的力量。